中国古代，几乎每个县城都有一座孔庙，现在，全国留存下来的孔庙大概有30多座，知名的包括山东曲阜孔庙、北京孔庙、南京夫子庙、苏州孔庙等。
南宋至清，杭州孔庙一直是临安府学所在地，也就是杭州的最高学府，南宋时，这里还短暂地做过一段时间太学，相当于当时的全国最高学府。
临安府学，直到清末科举制度废除才停办。再后来，到上世纪六七十年代，孔庙变成杭州碑林，珍藏各种碑刻、拓片等。
这次孔庙的复建，分东西两部分，东半部为碑林，西半部为孔庙。
大门设在西半部，叫棂星门，进去右转可到碑林。再前行，到戟门，才是孔庙真正大门，进去后，眼前是大成殿，内有孔子塑像，塑像参照山东曲阜孔庙塑像，高冠宽袍，慈眉长髯。
东面碑林，整体布局为江南园林式，主要建筑有太学堂、文昌阁、天文星像馆、国学馆、石经阁等，周围一圈碑廊，将展示450多块石碑。
其中，天文星像馆里放的是吴越王钱元瑾墓室顶部发现的天文图石刻，石经阁里放的是南宋皇帝赵构和皇后吴氏亲笔书写的85块石经，这些石经曾作为古代学生标准课本，也是杭州碑林的“镇馆之宝”。