南宗与曲阜衍圣公的关系
大宗主衍圣公对衢州翰林博士拥有绝对的管辖权。衢州翰林博士必须随时将情况报明衍圣公府。
清代对世袭翰林院五经博士有严格的规定，将应袭者的亲供与里邻、亲族甘结，附上应袭者三代履历由西安县逐级转呈，经衍圣公批示，呈请吏、礼部选任。吏、礼部批准后，经予文凭，咨文衍圣公府，转发至翰林公署。衢州翰林博士接到文凭后必须在规定期限内到任，延期不得超过一个月，并将到任时间上报衍圣公府，转报吏、礼部。
民国二年北洋政府颁布《崇圣典例》保留衍圣公爵位，改衢州世袭五经博士为世职“南宗奉祀官”，奉祀官的承袭由衍圣公咨文“地方行政长官呈明内务部核准”，承袭过程中仍需族长、各支房长及邻右出具甘结，附上应袭者三代履历相关宗图，印花税洋一元，付衍圣公府掌书厅监印等手续费30元，一并呈衍圣公府，再由衍圣公府将相关文件及印花税交由山东省长转呈内务部。待内务部批准后，发给任命执照，经山东省长交衍圣公府，再札付南宗奉祀官收悉。
现存孔氏南宗《钦定孔氏家规》是明正德元年（1506）衢州知府沈杰制定，并上奏朝廷钦准刊行。
第一条：遵制典。要求孔氏南宗子孙严守本分，遵崇制典，不得觊觎北宗衍圣公之职。为恐后世南北两派子孙“互相嫌隙，妄起争端”，因此严立规戒，“行令在衢子孙永遵制典，恪守祖风”，“有违者以不忠不孝论，审之重典，永不叙录”。
第七条：责报本。规定“南渡孔氏子孙，每十年一赴阙里，谒拜圣祖家庙，祭扫山林……就令会同南北宗谱，开保历代子孙名讳，居曲阜县者书引于前，居衢州府者书引于后……且以见我国家一统文明之化普及南北……”。
以上资料与曲阜存档案相符，如曲阜所存南谱记载“世祖皇帝及时宰之意谓洙当袭爵无疑洙乃以子非亲出而又志欲回南，上章力辞而行”“津子公许改名思许继洙后”。