家谱，是记载一个家族繁衍迁徙的历史文献，曾经被作为维系宗法制度和祖先祭祀的工具而被奉为圣物。然而在上世纪中叶的“文化大革命”中被作为“旧时代”的遗物而惨遭毁灭。浩劫之后，家谱的性质和现实意义重新被人们所认识，被认为与国史和地方志同为中华民族历史文化大厦的三大支柱。家史如国史，编修须有原则规章可循。本届续修委员会经过反复磋商并咨询谱牒专家，参考旧谱体例，编定本届续修体例，特说明于左。
一、 版式
家谱作为传统文献，其版式经过千年严格而成定例，故本届续修仍用传统竖版。家谱一般分为欧式（欧阳修所创）和苏式（苏轼所创），本谱沿用苏式。旧谱空格和提行未作保留以适应现代的阅读习惯，但是部分文献仍保留原式，以便阅者了解古代文件的行文格式。
二、 文字
由于简化字推广已久，今人多不识繁体字（正体字），故采用简化字。但是一些名字，为反映古人取名文化仍用繁体。一些容易导致歧义，及没有对应简化字的，也仍用繁体。
三、 标点
旧谱没有标点，原计划将全谱加注标点，但是限于精力和古文水平，只将历代序跋和述圣事迹和子宣公传等文加注标点。
四、 文献资料
本届续修的首要目的是抢救历史资料不致泯灭，故旧谱所有文献悉数收录，不作任何删节；
补录部分民国及后来的一些文献资料。由于精力所限，未能广为搜集。
五、 章节次序排列
基本依照民国江南谱的次序编排，但也作适当调整。句容孔巷旧谱也作整理归入相应章节。本谱分九个章节影像纪、续谱资料汇编、宗族庙幕、尊崇纪、恩荣纪、礼乐志、艺文纪、支派世次纪和懿德纪。
六、 影像纪
本次新增图片资料，先圣刻像列于首，后列曲阜衢州孔氏胜迹照片、各地古迹照片、本届续修活动照片、捐资人员照片、老照片。
七、 资料汇编
除本届续修的文件，还包括历代谱跋、列届续修人员名录、版谱数目，以便阅者能够了解历次修谱的过程和艰难。历代谱跋按年代、总谱、南宗谱、支谱次序排列，手书序跋列于前。
增加帐目清单，以向族人公示本届续修的收入开支状况。
八、 宗族庙墓
收录族规家训、宰辅公（讳贞运）家书、庙墓祭规祭文和庙墓修建文记。
九、 支派世次纪
姓源考、世系总编和爵系纪记载黄帝至各支始祖的世系资料，原列于卷二，现改各支前，以使本族传承关系一目了然。旧谱仅载本祖，现增补列祖兄弟，并注邻近未入本谱分支的世系来源，以便联族。
各分支依长幼次序分叙。衢州长支（句容百社）、衢洲四支（句容下坝）在先，衢洲五支（句容青城、金坛孔达）和镇江支（句容大蜀）在后。旧谱按外迁列于后排列，丹阳各支为长却列于后，今移阳山之前，而孔达祖居为幼去列于前，今改阳山后。
十、 支派图
支派图仍按旧谱六世相承。孔巷、天井和新城旧谱没有支派图，现依例增补。
名下注功名、官职、迁徙地和过继关系。新录入女性名下书女，领养子名下注养子/女。
早殇、未婚及无子者也同样列出，以父母一体所衍，不忍弃之。
十一、 世次纪
世次纪俗称“年表”和“世表”，今仍用旧名。
江南旧谱以大小字体排列条目清晰，阅者了然，且版面更为节约。但是由于电脑排版效率所限，因而只能用孔巷旧谱格式，只有本名为大字，其余皆为小字。
每人名下书某公/姑第几子/女，生卒年月日，职业、职务、所受表彰或简历，娶嫁/招赘某人，配偶出生年月日，生子女。为入谱女儿书嫁某地某人。
新城和潘盖旧谱父名至于本人名上，现统一为本人名下。
新城旧谱未书子名，查阅不便，今统一补录。孔巷旧谱将无后族人只列与父名，乃至高祖名下，今一视同仁予以单列。
十二、 谱名
前次修谱以来，多数人并为依照孔氏行辈起名，今规定必须另起谱名方可入谱，先用名作为字或又名入谱，以便查询。
十三、 行次
江南谱至民国仍保留每代按房依长幼次序排列行次的古俗，世次纪也依行排列顺序。因现已无排行习俗，故新入谱族人未排行次，新世次纪用按支派图顺序排列。旧世次纪仍旧，未作改动。
十四、 懿德纪
即传赞，记述族人达者、贤者以及节妇烈女的生平事迹，以垂范后世。其中多有自强不息成就与困厄的可歌可泣的故事，但内中也有歌颂不合人性的封建纲常，但是作为历史资料悉数保留，以便阅者深入了解我族历史。
新入谱族人不收赞语，以免有虚词粉饰之嫌。杰出族人和续谱有重要贡献的族人可以立传/简历。但是传将直接排在世次纪本人名下，不另立入懿德纪。
旧谱传赞列于名下的仍依旧谱。
十五、 女性
女儿和儿子按长幼顺序一样入谱，但是书明女性。
女儿子女如果随孔姓也可入谱，但须说明为某女之子女。杜绝将女婿改孔姓入谱的错误行为。
配偶列全名，而不是仅书某氏或某姓。
十六、 养子
为遵循和谐社会原则，作为孔氏家族成员的养子也予收录，但是必须注明领养关系，不致混淆血脉传承关系。
原考虑将女儿孔姓子女和领养子女照孔巷谱旧例列与谱后，但是为避免歧视之嫌和查阅方便仍列于卷中。

                                                                  《江南孔氏族谱》续修委员会